Neo gikk fra en døsig drøm til en voldsom virkelighet da han valgte sannhet foran illusjon. Med sine unike evner må Neo gå til kamp mot maskinhæren i "The Matrix". Hvis han feiler, er konsekvensene grufulle. Da beseires Zion - menneskenes siste fristed. Innbyggerne stoler på Morpheus' overbevisning: Neo vil oppfylle orakelets profeti og frigjøre menneskene fra maskinenes mektige grep. Neo og Trinity er styrket av kjærligheten til hverandre og troen på egne evner. Sammen med Morpheus velger de å oppsøke "The Matrix" på nytt og slippe løs hele sitt eksplosive arsenal mot undertrykkerne. Men det finnes krefter i "The Matrix" som selv Neo har problemer med. Agent Smith, Neos formidable motstander fra den første kampen mot maskinene, lar seg ikke slette av systemet. Han er drevet av den menneskeligheten han en gang foraktet, og han bekjemper hva som helst for å få hevn. På veien mot mer innsikt om "The Matrix" og sin egen rolle, må Neo konfrontere større motstand, dypere sannheter og et verre valg enn han kunne forestilt seg. Han må forme all sin kjærlighet, sannhetssøken, tro, kunnskap, hensikt og fornuft til ett våpen mot maskinene. Men hva om han feiler? Da står Zion for fall .. Filmen fikk yerningkast 3-5. Prod.: Warner Bros./Village Roadshow Pictures/NPV Entertainment/Silver Pictures Production.