Carl, Assad og Rose i avdeling Q begynner å grave i saken om den pedofilisiktede William Stark som er sporløst forsvunnet. Samtidig blir unggutten Marco anholdt på grensen med Starks pass. Det viser seg snart at Marco sitter på opplysninger som mektige krefter er villige til å gå over lik for å skjule. Carl, Assad og Rose i avdeling Q står overfor en sak med innviklede familieforhold, groteske overgrep, korrupsjon og kriminalitet med rekkevidde fra den danske finansverdenen til et internasjonalt, kriminelt nettverk. «Marco-effekten» er femte film basert på Jussi Adler-Olsens romanserie om avdeling Q, men denne gangen er rollebesetningen skiftet ut; Ulrich Thomsen debuterer i rollen som Carl Mørck, Zaki Youssef som Assad, og Sofie Torp som Rose.
