Smilla Jaspersen er glasiolog og halvt grønlandsk. Hun fatter mistanke om at noe er galt da den grønlandske gutten Esajas dør etter et fall fra det snødekte taket på leiegården der han bor. Smilla følger Esajas spor og føres inn i et nett av ulovlig internasjonal handel, uetisk medisinsk forskning og dansk misbruk av kolonimakt på Grønland.